巴氏杀菌机的杀菌流程：封口后的罐或 ( 瓶 ) 经输送带的传送，进入巴氏杀菌机的内部。在巴氏杀菌机中的各个温度区域内，产品的温度受到精细的调节。当通过隧道时，容器受到不同温度水的喷淋，也就是预热阶段、加热阶段（杀菌阶段）、和冷却阶段。
巴氏杀菌机的产品特点：本巴氏杀菌机流水线采用巴氏杀菌工艺，适用于腌制菜、低温肉制品、酸豆奶制品、果冻、玻璃瓶、马可铁罐及周转箱装食品的巴氏灭菌。
在使用巴氏杀菌机前，巴氏杀菌线，为了确保机器的正常运行，需要做如下的性能测试：
一、首先打开真空泵奶泵循环水泵的冷却水，巴氏杀菌线工作原理，使冷却水供应充分。
二、检查冷却水水箱，确认水箱中有水。检查真空表是否在零位及各泵接口，四段式杀菌器各接口是否接对，巴氏杀菌线，各接口有无松动露气，检查无误后，再进行下一步操作。
三、先不要开泵空泵，用水在四段式杀菌器从闪蒸器间循环待加热温度升起后，可以进料。
四、同时打开四段式杀菌器供料泵及闪蒸器出料泵，使闪蒸器内料液液面保持在视镜中线以下位置，全自动巴氏杀菌线，待料液面平稳后，进行下一步工作。
五、打开冷却水循环系统，使冷却水液面保持在冷却水液面保持在冷却器镜中线位置开始循环。
六、开真空泵开泵前，先将真空泵关阀然后逐渐开启让真空泵升高。
七、在真空泵升高过程中，因真空泵影响闪蒸器出料泵，出料呈减小，液面上升必须关小四段式杀菌器进料口，使液面稳定。因此时真空泵不必达到较大（0.08）。
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