本科的系统位置甚不统一，大致分三派意见。Engler各子系统，先归Sapindales-Celastrineae，而后，Celastrineae升为Celastrales，则归于彼。Takhtajan（1987），Cronquist（1968-1988）均置于Rosidae，但Takhtajan冠以超目Celastranae；Thorne，Young两系统同归于Theales，以及K.Kubitzki（1997）则归于Theales，Kubitzki甚至将本科置于包括Diapensiales和Ebenales的广义的Theales中，且置于Ebenaceae和 Diapensiaceae之间。惟Dahlgren系统将本科置于Corniflorae-Cornales，较Sycnplocaceae和Icacinaceae稍前。中国植物志编辑部认为仍以置于Celastrales附近，与Icaeinaceae最近为妥，归Rosidae如Takhtajn（1996），其与Celastraceae的区别主要为无花盘，子房每室具1胚珠。
分类学家从花的比较形态研究，北美冬青修剪技术，提出卫矛科、刺茉莉科（Salvadoraceae）、无患子科、鼠李科、柿科、报春花科等作为冬青科的假想近亲。
法国冬青植株
花芳香通常生于序轴的第二至第三级分枝上无梗或有短梗萼筒筒状钟形长2~2.5mm无毛萼檐碟状齿宽三角形花冠白色后变黄白色有时微红辐状直径约7mm筒长约2mm裂片反折圆卵形顶端圆长2~3mm雄蕊略超出花冠裂片花药黄色矩圆形长近2mm柱头头状不高出萼齿果实先红色后变黑色卵圆形或卵状椭圆形长约8mm直径5~6mm核卵状椭圆形浑圆长约7毫米直径约4mm有1条深腹沟花期4~5月有时不定期开花果熟期7~9月。
北美冬青与冬青科大多常绿树种不同，其特点是冬季落叶。落叶后，密集、亮丽的红果挂满枝头，十分耀眼和喜庆。在欧美北美冬青作为切枝观果、景观美化等广泛栽培应用。国内每年从荷兰等国家大量进口北美冬青(市场叫名红豆)成品切枝，投放花卉市场，北美冬青两米苗，销售价格昂贵。2006年杭州润土园艺科技有限公司引进 'Oosterwijk'(奥斯特维克)等北美冬青观赏品种，引种试验表明，这些品种表现抗性强，北美冬青培育，适应性广，生长中等，日照北美冬青，能正常开花、结果和冬季落叶，是秋冬切枝、环境美化和盆栽的优良观赏树种。
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