由于滴灌容易做到的水肥调控，在土层深厚的情况下，可以将根系引入土壤底层，避免夏季土壤表面的高温对根系的伤害。
滴灌施肥可以根据作物的需肥规律施肥。吸收量大的时候多施肥，以色列海法水溶肥，吸收少时少施肥。很多作物封行时正是需肥高峰期，但人进不了田间，水溶肥，无法追肥（如马铃薯、甘蔗、菠萝等），全水溶肥，而滴灌则不受限制，可以随时追肥。
滴灌施肥要特别注意哪些问题？
一是过量灌溉问题。滴灌施肥最担心的问题是过量灌溉。很多用户总感觉滴灌出水少，心里不踏实，结果延长灌溉时间。延长灌溉时间的一个后果是浪费水，另一后果是把不被土壤吸附的养分淋洗到根层以下，浪费肥料。特别是氮的淋洗。通常水溶复合肥料中含尿素、硝态氮，这两种氮源是最容易被淋洗掉。过量灌溉常常表现出缺氮症状，叶片发黄，植物生长受阻。二是施肥后的洗管问题。一般先滴水，等管道完全充满水后开始施肥，原则上施肥时间越长越好。施肥结束后要继续滴半小时清水，将管道内残留的肥液全部排出。许多用户滴肥后不洗管，最后在滴头处生长藻类及微生物，导致滴头堵塞。准确的滴清水时间可以用电导率仪监控。
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