膜生物反应器工艺流程形式及运行条件的优化。如：加强反硝化作用以提高氮的去除率；同时硝化反硝化和短程硝化现象及控制因素的研究；能耗的降低措施和技术；污泥停留控制措施和时间的研究；膜组件和新型污水处理技术的组合以及运行方式的zui优化研究等。
MBR经济性研究。在目前国内外尤其是国内的经济发展水平、膜产品供应状况和规范设计要求的条件下，MBR污水处理设备，MBR用于污水处理的zui大经济流量的确定是一个亟待解决的课题。同时需求界定和推荐比较适于采用MBR技术处理的污水类型。
膜生物反应器中常用的是MF、UF或NF膜，MBR污水处理设备，由这几种膜制成的膜组件与生物反应器组合而成膜生物反应器。根据膜组件在生物反应器中功能作用的不同，MBR污水处理设备规格，可以将MBR分为三类，分别是膜一曝气生物反应器(Membrane Aeration Bioreactor，MBR污水处理设备简介，MABR)(无泡曝气，用于高需氧量的废水处理)、萃取膜生物反应器(Extractive Membrane Bioreactor，EMBR)(用于工业废水中优先污染物的萃取)、膜分离生物反应器(Biomass Separation Mem．brane Bioreactor，BSMBR，简称MBR)(截留和分离固体)。
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