在我国，分布式能源系统的应用还存在一些不足之处：
(1)负荷分析不够全面、准确、细致。对分布式能源系统的设计，负荷分析是非常必要的，天然气分布式能源设备，如果对建筑的负荷统计或估算不够细致，就会对运行产生相当大的影响。例如，北京次渠项目中，燃机发电量80kW，余热直燃机功率2O万kcal，设计电负荷为320kW，供热、供冷面积为2800m2 ，但实际电负荷只有不足30kW，微燃机只能处于低出力工况，导致燃机发电效率很低，整个系统的电热比很低，最终导致了一次能源的利用效率降低，失去了分布式能源系统的最初设计意义。所以在今后的分布式能源系统设计工作中，负荷分析工作务必要做到细致、准确。
(2)对于过渡季节，分布式能源系统利用不充分。对于分布式能源站，冷热负荷一般是通过利用燃机的余热获得，由于夏季和冬季具有稳定的冷、热负荷，余热需求量较大，动力设备可以保持比较稳定的运行状态，而在春季和秋季，无较大的冷热负荷需求，可能就会使整个系统处于低效运行状态或停运状态，降低了系统的效率和使用率。
(3)缺乏权威的评价标准。分布式能源系统是一个多能量产品输出的复杂系统，所以如何对系统进行整体评价成为研究的重点和难点。由于冷热电是不同的产品，很难直接进行定量比较，目前的评价准则主要有火雨效率、节能率、折合发电效率等几种，但这些评价方法本质上都是对冷热电根据不同的标准分别进行评价。根据分布式能源系统的能量梯级利用特点建立系统评价标准对分布式能源系统的研究将具有非常重要的意义。
(4)需要进一步加强天然气的价格稳定机制。由于分布式能源系统燃烧的是高品质的清洁能源，滨州天然气分布式能源，其运行成本受燃料价格的影响特别大，天然气分布式能源公司，尽管一个热力匹配完好的冷热电三联供系统其经济性也并不一定好。所以稳定的价格机制也是影响分布式能源站推广的一个主要因素。
(5)分布式能源站的并网、电价问题。目前，国家在财税和金融等方面还未出台相关的扶持政策，如电价补贴、接入系统投资、节能奖励等方面给予优惠政策，而且尚未制定和完善行业技术标准以及并网运行管理体系。如欧盟要求成员国支持分布式能源系统发展，在电网系统和税率上支持分布式能源系统，尽可能为高效小型分布式能源系统机组并网提供方便。欧洲委员会已经批准了强制购买热电联供和可再生能源发电的政策。所以，分布式能源站的大力推广，还需要政府在这方面加大对分布式能源的扶持力度。
分布式能源系统的优点
分布式能源系统的最主要优点是用在冷热电联产中。联产符合总能系统的“梯级利用”的准则，会得到很好的能源利用率，具有很大的发展前景。大型(热)电厂虽然电可远距离输送，但需建设电网、变电站和配电站并有输电损耗，天然气分布式能源建设，而对于热，尤其是冷，就不像电能那样可以较长距离有效地输送。所以，除非事先特殊设计、安排好，否则，难以达到输送冷、热能的目的。因为大电厂选址有其自身的要求，一般来说，附近难以有足够大量的、合适的冷、热能用户，无法进行有效的联产。分布式能源系统却正好相反，按需就近设置，可以尽可能与用户配合好，也没有远距离输送冷、热能的问题，大电网的输电损失问题也不存在了。所以，虽然分布式能源系统纯动力装置本身效率低、价钱贵，但可以充分发挥其联产的优点，体现出它的优越之处。分布式能源系统还可以让使用单位本身有较大的调节、控制与保证能力，保证使用单位的各种二次能源能够充分供应，非常适合对发展中区域及商业区和居民区、乡村、牧区及山区提供电力、供热及供冷，大量减少环保压力。总之，分布式能源系统可满足特殊场合的需求，为能源的综合梯级利用提供了可能，为可再生能源的利用开辟了新的方向，并可为提高能源利用率、改善安全性与解决环境污染方面做出突出贡献。这也是一个很重要的优点。
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