后处理主要内容是包装，制品不同包装也不同。
对于生物制品，冻干结束要向箱内充入干燥无菌的空气和氮气，然后在无菌室内将容器封口，或在干燥结束时，在冻干箱内真空加塞。
对于食品，干燥终了时也要充入干空气或氮气，包装时室内保持相对湿度为20%左右，最好采用真空包装或真空充气包装。对冻干食品包装的要求有：密封性；防护性；易于运输；遮光性。
诸城市冻干机特点：
本机种采用导热液循环系统进行冷却和加热。在50～80℃的范围内，能使同一块搁板上不同位置和板与板之间的温差为±1℃。
完整的控制和测量系统，可以保证收集到生产时所需要的所有数据，设备上备有共晶点测定仪，可以研究冻干产品的物理特性及确定最佳冻十工艺曲线。这些功能对一台试验型冻干机是相当重要的。
