巴氏杀菌机的杀菌的原理是在一定温度范围内，温度越低，细菌繁殖越慢；温度越高，繁殖越快。但温度太高，细菌就会死亡。不同的细菌有不同的最适生长温度和耐热、耐冷能力。巴氏消毒其实就是利用病原体不是很耐热的特点，用适当的温度和保温时间处理，将其全部杀灭。但经巴氏消毒后，仍保留了小部分无害或有益、较耐热的细菌或细菌芽孢。
巴氏杀菌机原理：
物料通过输送带的传送，进入隧道式喷淋杀菌、喷淋冷却、常温出瓶。在巴氏杀菌机中的各个温度区域内，喷淋式巴氏杀菌机，容器受到不同温度水的喷淋，也就是杀菌阶段和冷却阶段。其采用了喷淋到较凉的容器上的水将会变热，这部分较热的水被用来冷却已经被杀菌处理过了的较热的容器，巴氏杀菌机型号，以便容器进行逐步冷却，这样既可以避免过热而造成的口味损失，南充巴氏杀菌机，又能够防止容器热应力的突变而产生碎瓶或瓶变形。并且加热区域和冷却区域相互连接起来之后，水浴式巴氏杀菌机，能量就得到了很好地再生利用——这就是称之为能量再生原理。隧道式巴氏杀菌机充分利用了这一热量平衡原理，能耗非常低，只有杀菌区域使用了有限的能源。
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