医院污水处理主要是消毒，即杀灭病原体。常用的方法是氯化消毒或用臭氧消毒(见水的消毒、废水氧化处理法)。医院排出的放射性废水常用贮存衰减法处理。医院常用的放射性同位素如131碘，32磷，198金，污水处理设备厂商，24钠等是半衰期较短的同位素，因此可以将放射性污水贮存于地下专用衰变水池内，保山污水处理设备，贮存时间为10倍于半衰期，把放射性浓度降到容许排放的程度。如果放射性污水的浓度很低，水量很小，也可用稀释法处理。
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